3-indoläädikhape on omamoodi taimne auksiin. Auksiinil on palju füsioloogilisi mõjusid, mis on seotud selle kontsentratsiooniga. Madal kontsentratsioon võib soodustada kasvu ja kõrge kontsentratsioon pärsib kasvu isegi tapab taimi. See inhibeeriv toime on seotud sellega, kas see võib esile kutsuda etüleeni moodustumist. Auksiini füsioloogiline toime avaldub kahel tasandil. Rakutasandil võib auksiin stimuleerida kambiumirakkude jagunemist; stimuleerida harude pikenemist ja pärssida juurrakkude kasvu; edendada ksüleemi ja floemirakkude diferentseerumist, edendada pistikute juuri ja reguleerida kalluse morfoloogiat. Elundi- ja kogu taime tasandil toimib auksiin seemikust seemnete valmimiseni. Auxin kontrollib hüpokotüüli pikenemise pöörduvat punase valguse pärssimist seemikutes; kui see läheb üle võrsete alaküljele, tekitab see haru geotropismi; kui see läheb üle võrsete taustvalgusele, tekitab see haru fototropismi; 3-indoläädikhape põhjustab apikaalset eelist ja viivitab lehtede vananemist. Auxin soodustab õitsemist, kutsub esile partenokarpsete viljade arengut ja viib viljade küpsuseni.